膀胱切片檢查在IC的診斷地位仍是眾說紛紜，大部分北美地區的醫師仍靠著臨床癥狀及膀胱鏡檢的標準來診斷IC，膀胱切片的目的僅在于去除是否合併其他特殊疾病（如癌癥）及確認病患某種特殊的病理變化。藉者切片檢查可以讓我們更了解病患的炎癥反應程度及型態，甚至膀胱纖維化程度，進而預測其預后。相反的在歐洲地區，切片檢查被認為是診斷的必要步驟（13），此種依賴切片結果來診斷IC或許用來說明歐洲及日本地區IC盛行率較北美為低的原因。總括來說，切片的結果并非是IC病理上所特有，無法作診斷的依據，IC可能是不同的病因對膀胱產生傷害，因而造成複雜的癥候群。